福知山市は、旧丹波国天田郡を中心とし何鹿郡（佐賀村の一部）と丹後国与謝郡（雲原村）と 加佐郡（大江町）に広がり、市域面積の76%は林野が占め耕地面積は7%程度で]、 綾部市から続く福知山盆地を中心とした平地、それをとり囲む市域面積の大部分を占める山地で構成される。

大阪市からは約70km、京都市、神戸市からは約60km、豊岡市、舞鶴市から約30kmの場所に位置する。 市内最高海抜は三岳山の839.17mにまで及び、最低海抜は7.11mである。 市街地は旧城下町を中心とし、由良川沿いに長田野工業団地周辺の住宅地まで伸びる。

周辺部には、郊外型ショッピングセンターのジャスコ、プラントなどを擁した開発地や、 旧町の集落が見られるが、大部分は多数の田畑が広がる。地形的には山地が多く、クマだけでなく、 シカやイノシシなどの多数の野生動物が生息している。 福知山の特産品である丹波栗などを含む農作物が狙われ、年度によって深刻な被害を農家へもたらすこともあり、 檻の共同オーナーを募集するNPO法人も存在する。